《侦探学园Q》的主角名字就叫做Q，和金田一一样，他是一名学业成绩不好但却有着非一般侦探头脑的男孩。Q是一名中三学生，本来已应该进行高中的升学考试的啦，但可惜他的校内成绩就连普通的高中都粘不上。而由于他的志愿一直是想成为一名伟大的侦探，因此他就前往一间专门培训侦探的学校“团侦探学园”面试，这间侦探学园的创办人名叫“团守彦”，是日本唯一一位得到持有枪械特许的名侦探。Q前往学园面试途中巧遇女主角美南惠，她也是到“团侦探学园”面试的，虽然她没有Q的侦探头脑，但她却拥有一项很特殊的能力：高度瞬间记忆能力。面试的题目并非一般的试题，而是一宗扑朔迷离的模拟案件，Q和可爱的南惠能否通过考验，进入这间“神奇”的侦探学园呢？让我们拭目以待吧……